O Eixo da Proteção tem como principais objetivos:

• Promover a melhoria da qualidade do Sistema de Promoção e Proteção da Criança, através da (re) qualificação e capacitação de instituições, serviços e respostas, com base no desenvolvimento de modelos de ação (avaliação e intervenção), formação e supervisão, cientificamente validados;
• Promover políticas públicas sustentadas na evidência empírica que garantam a promoção dos direitos e a proteção das crianças e jovens.